Signature STR et haplogroupe du chromosome Y des descendants de Jacques SAVARIA qui l'ont dans leur patrilignage

Voici ce que je sais à propos de l'ADN du chromosome Y des hommes SAVARIA qui possèdent Jacques SAVARIA (m Suzanne LACROIX) dans leur lignée des pères.

La signature ADN-Y de l'ancêtre Jacques SAVARIA a été triangulée à partir de plusieurs de ses descendants et est décrite à  https://www.francogene.com/triangulation/TRI0479.php

Les valeurs des marqueurs STR sont les suivantes:




L'haplogroupe de cette signature est E-M35→PF2405→M81→PF2546 (selon FTDNA).

J'ai commandé auprès de YSEQ.COM un séquençage complet (hg38 couverture16.0215x) du chromosome Y d'un homme SAVARIA descendant de l'ancêtre Jacques.  

Voici le sentier phylogénétique des haplogroupes par lesquels la branche des SAVARIA est passée depuis l'Afrique jusqu'à ce jour : 


De nouvelles mutations SNP ont été trouvés (hg38) et inscrites à la base-de-données que maintient Thomas KRAHN pour l'ISOGG à  https://ybrowse.org/gb2/gbrowse/chrY/?

A30660 chry:7669830 C to G (Y305934)
A30661 chry:7844509 C to A (Y305713)
A30662 chry:13538554 G to A (-)
A30663 chrY:14206336 T to C (Y305975)
A30664 chry:15383043 C to T (Y306004)
A30665 chrY:19197253 A to G (Y305904) *>A30665 retenu par FTDNA 
A30666 chry:19542433 C to T (Y305985)
A30667 chrY:19775370 A to G (Y305762)
A30668 chrY:21110509 A to T (-)
A30669 chrY:21220245 A to G (Y305816)
A30670 chrY:21454392 T to A (Y305967)

Les (labels) des SNP ont été obtenus de la même base le 2024-05-01.

Ces SNP sont pour le moment ''privés'', en ce sens qu'ils n'ont été trouvés que chez le SAVARIA testé. Le statut de certains de ces SNP pourra passer de privé à familial (ou patrilinéaire) lorsqu'ils seront trouvés dans l'ADN-Y d'autres hommes SAVARIA. 
Ils serviront alors éventuellement à fleurir davantage l'haplogroupe E-PF2546 qui est illustré à FTDNA par l'arborescence suivante:  https://discover.familytreedna.com/y-dna/E-PF2546/tree

Les résultats BAM du WGS ont été soumis à YFULL.com et l'haplogroupe des SAVARIA apparaît aussi sous E-PF2546* (cas YF094490) à  https://www.yfull.com/tree/E-PF2548/



Selon une note récente de YFULL.COM, le SNP PF2546 pourrait être déplacé sous E-Y638306 dans leur taxonomie. 
(à suivre)

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Voici le sentier de mutations qui correspond à lignée des hommes SAVARIA. Le SNP PF2546 est d'origine AMAZIGH (i.e. = Berbère). 

A0-T > A1 > A1b > BT > CT > DE > E > E-M5479 > E-P147 > E-P177 > E-M215 > E-M35 > E-Z827 > E-L19 > E-M81 > E-CTS4236 > E-PF2548 > E-Y8827 > E-PF2546  
> E-A30665 (selon FTDNA)

Selon YFull, la mutation PF2546 se serait formée vers 2,300 bp (présent=1950). La mutation A30665 est plus récente et, à ce jour, singulière aux hommes SAVARIA. 

De nombreux nord-africains ou Magrébins (Maroc, Tunisie, Lybie, Mauritanie..) possèdent la séquence M183>Z1200>PF2548> PF2477>PF2546 sans posséder le SNP apical (le plus récent) A30665. 

De plus, quelques lignées d'hommes d'origine européenne implantées au Québec possèdent aussi cette séquence, dont des PROULX, ROSE, RUSSELL, BOISVERT, &c. 

(voir les tableaux à https://www.familytreedna.com/public/E-M81?iframe=yresults et à https://www.familytreedna.com/public/E3b?iframe=yresults ).

Nous ne savons pas encore quand le SNP A30665 s'est produit. Était-il déjà présent dans l'ADN-Y du fondateur Jacques SAVARIAU ou est-il apparu par la suite chez l'un de ses  descendants ? Pour le savoir, il faudrait en tester la présence dans les chromosomes Y de plusieurs descendants du fondateur Jacques SAVARIA. Ce test peut consister à commander le SNP apical A30665 auprès de la compagnie YSEQ.NET. Le test coûte seulement 19.00€.

Par contre, nous savons que le SNP PF2546 est plus ancien et il a eu le temps de se propager partout autour du bassin méditerranéen, en Europe et dans les colonies outre Atlantiques.

Pour visualiser la présence de PF2546 dans le monde, visiter la page 
FamilyTreeDNA Discover - Y-DNA Haplogroup E-PF2546 dont voici la partie couvrant l'Afrique et l'Europe. 

 



Figure PF2546.
Régions où l’on trouve le plus fréquemment l'haplogroupe PF2546. La densité est basée sur des informations autodéclarées par des centaines de milliers de testeurs d’ADN Y et de participants à des études académiques. Mauritanie 58,3%; Sahara occidental 40%; Maroc 21,9%; Algérie 22,9%; Tunisie 18%; Lybie 17,5%; Mali 10,3%. 

Selon YFULL, PF2546 serait apparu vers 2300 ybp, (CI 95% 2700 <-> 1900 ybp), c'est à dire il y a ~2376 ans. 

Si nous examinons la figure suivante empruntée à  
https://discover.familytreedna.com/y-dna/E-PF2546/story, nous constatons que plusieurs cas d'ADN-Y ancien appartiennent à l'haplogroupe E-PF2546.



Il s'agit de cinq momies Guanches [https://fr.wikipedia.org/wiki/Guanches] trouvées dans des cavernes de sépultures sur Ténérife (îles Canaries). Ces momies possèdent la séquence jusqu'au SNP PF2546, l'avant-dernier de la séquence des SAVARIA. 

J'ai comparé les valeurs des 25 premiers marqueurs STR des hommes SAVARIA à celles des mêmes marqueurs de la momie Guanche GUN011 (Kit 281229 du projet E-M81 à FTDNA; GUN011 à YFull) et les SAVARIA et cette momie partagent les mêmes valeurs sur 24 des 25 marqueurs, ce qui peut être significatif d'une parentèle relativement récente. Je partage 24/25 avec mon propre père. Bien sûr cette concordance peut résulter d'une convergence fortuite vers des valeurs identiques. 24/25 correspond à une moyenne de 18 générations selon le calculateur de TMRCA McDonald. 
 
Mais le fait de posséder des signatures qui concordent fortement à la fois au niveau des marqueurs STR et des SNP apicaux suggère des origines communes relativement récentes. 

Je n'ai pas encore fait la comparaison des valeurs STR avec les autres momies. Lors de cette comparaison, il faudra aussi déterminer si certaines possédaient des SNP parmi les ceux déclarés privés au SAVARIA testé. 

À propos de Guanches, je vous invite à lire l'article de Emma Lira Publication du 4 juin 2024 du magazine National Geographic à 

Dans l'ensemble, 
Les SAVARIA ont des origines relativement lointaines Amazighes.  
La question à laquelle il faudra répondre est par quel processus migratoire l'ancêtre des SAVARIA s'est retrouvé en France, dans la région de La Rochelle (Île de Ré) et à quelle époque cette migration s'est produite.

Le trajet de peuplement généré par le SNPTracker s'arrête en Afrique du Nord, face au détroit de Gibraltar et, par manque de données, ne se poursuit pas en Europe.  Ce trajet pourra être complété lorsque les Français et Espagnols accepteront de se faire tester pour leur ADN-Y [https://scaledinnovation.com/gg/snpTracker.html].




Concordances des valeurs de marqueurs STR avec des clients YFULL

À ce jour, 2026-02-26, les concordances les plus fortes avec la signature SAVARIA sont présentées au Tableau suivant, où chaque ligne est un homme qui a été testé par un test NGS (Next Generation Sequencing: un Big-Y, un WGS). 


Le nombre de marqueurs comparés est dans la colonne 1, le nombre de marqueurs différents dans la colonne 2. La distance est inversement proportionnelle au degré de concordance entre deux signatures. Ainsi le cas Y100293 du Maroc est distant de seulement 0.017 (5/287) et son plus récent SNP, le PF2546, est le même que celui des hommes SAVARIA. 

Bien que les autres concordants présentent des SNP plus récents que le PF2546, plus en aval dans la classification, il ne faut pas les ignorer. D'abord, certaines branches d'hommes développent des SNP plus fréquemment que d'autres. De plus, la cladistique n'est pas toujours en mesure de tenir compte de tous les nouveaux SNP découverts en les incorporant à une classification. En fait les SAVARIA possèdent des SNP récents qui n'ont pas été intégrés à la taxonomie de l'ADN-Y de l'haplogroupe E. Néanmoins, l'examen de ce Tableau emprunté à YFull suggère fortement que la majorité des proches concordants des SAVARIA ont des origines Nord-Africaines.  


Concordances des signatures ADN-Y avec des lignées d'hommes québécois.

La signature ADN-Y des SAVARIA concorde fortement avec celles de deux lignées d'hommes québécois, celles des PROULX dit BOISANCY et des BOISVERT dit DENEVERS. 

L'ADN-Y des hommes de ces trois lignées possèdent le SNP PF2546 et les valeurs des marqueurs STR sont assez semblables.

Voici leurs signatures STR côte à côte dans un même Tableau:



Le TMRCA peut être estimé en se basant sur le nombre de marqueurs identiques entre deux signatures. Cet estimé peut être fait à l'aide du calculateur de TMRCA (Time to Most Recent Common Ancestor) [http://www.lyonsfamilyden.com/tmrca-calculator.html].

Savaria et Boisvert partagent 27 marqueurs sur 39 (111g)
Savaria et Proulx partagent 20 marqueurs sur 39 (202g)


Partant de ces partages j'ai calculé les estimés du TMRCA. L'estimé du TMRCA dans le cas BOISVERT de 27/39 est de 111 événements générationnels, soit 55 générations et de 202 événements générationnels, ou de 101 générations dans le cas des PROULX.  Une génération correspond à environ 30 ans. Le TMRCA entre SAVARIA et BOISVERT aurait donc vécu il y a environ 1,650 ans et celui des SAVARIA et PROULX il y a 3,000 ans. Il est donc futile de penser que les SAVARIA, PROULX et BOISVERT possèdent un ancêtre commun en patrilignage autre que dans un horizon ancestral lointain.  



Recherches qui restent à faire au niveau de l'ADN-Y 

1. Dans un premier temps il faudrait identifier les SNP familiaux parmi les SNP ''privés'' qui ont été mis en évidence dans le cas dont l'ADN-Y a été l'objet d'un séquençage complet (voir plus haut). Le SNP A30665 a été retenu par FTDNA comme SNP caractéristique de la branche des SAVARIA mais je ne sais pas sur quelle base.  
Comment procéder ? Soit par un séquençage complet du chromosome Y d'autre homme SAVARIA, soit par des tests ponctuels sur les SNP concernés dans la liste des mutations SNP présentées plus haut. Les SNP qui apparaitront en commun chez ces deux hommes seront des SNP que possédait leur MRCA (Most Recent Common Ancestor) et si leurs patrilignage convergent sur l'ancêtre Jacques SAVARIA, alors c'est que ce dernier fondateur possédait lui aussi ces SNP. 

2. Déterminer si certaines les momies Guanches possèdent des SNP plus récents que le PF2546 et si parmi ceux-ci certains feraient partie des SNP privés du SAVARIA dont le chromosome a déjà été séquencé. L'ADN des momies Guanches a été entièrement séquencé par au moins deux laboratoires. 
 


Jacques BEAUGRAND PhD
2026-03-06

Beaugrand.Jacques@uqam.ca











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